Когда Брайану было восемь лет, он очнулся в погребе возле своего дома в Канзасе, у него шла кровь из носа, и он понятия не имел, как там оказался. После этого его жизнь стала другой — он боится темноты, мочится в постель, и ему снятся страшные сны. Сейчас Брайану 18. Нилу тоже 18, и он жаждет любовных отношений, которые были у него с тренером малой лиги, когда ему было восемь лет. Когда молодые люди знакомятся, они начинают осознавать, что события, оказавшие на них самое сильное влияние в детстве, были не тем, чем казались…
Жизнь Каллиопы Жирар идёт своим чередом: у неё есть неплохие перспективы в учёбе, а также любящий молодой человек. Но всё резко меняется, когда вместе с возобновившимися приступами эпилепсии в её жизнь вторгаются воспоминания о человеке, всем известном как "Мёртвый Билли". Теперь девушка не может найти себе места, пока не разберётся со своим прошлым, омрачённым жестокостью и насилием со стороны этого загадочного мужчины...
Действия картины разворачиваются в мире, который контролируют биоинженерные корпорации. Их сверхзадача - синергия компьютера и человека: "чипизация" неблагонадежных, прошивка мозга для тотального контроля над обществом. Привлекательная идея научного прогресса незаметно для гуманистов выродилась в манию кибернетической тирании. На фоне этой глобальной болезни человечества высвечивается трагическая судьба отдельного человека, подминаемого системой, но не теряющего надежды на свободу и счастье. Главного героя "Прошивки" Люка Гибсона лишили прошлого, перепрошив его сознание с помощью биокомпьютерного имплантата. Теперь Люк борется за свое будущее, узнав истинные мотивы ученых.