Вторая часть трилогии об иллюзорности окружающей действительности. Машины стремятся взорвать город людей Зион. Для уничтожения этой армии и спасения людей борцы за свободу Нео, Тринити и Морфиус должны сконцентрировать все свои силы и возможности. Ударные сцены - борьба Нео с сотней клонов агента Смита, и возвращение мертвой Тринити к жизни. Продолжение следует.
Борцы за свободу Нео, Тринити и Морфеус продолжают руководить восстанием людей против Армии Машин. Для уничтожения системы репрессий и эксплуатации они вынуждены прибегнуть не только к арсеналу превосходного оружия, но и к своим выдающимся навыкам.Участие в миссии по спасению человеческой расы от ее полного истребления приносит им более глубокое понимание конструкции Матрицы и осознание центральной роли Нео в судьбе человечества.