Тринадцатилетняя девочка Ичиго Момомия гуляет в парке с парнем, в которого давно влюблена. Однако после «неожиданного землетрясения» она узнает, что ее ДНК объединилось с ДНК ириомотейской кошки. Момомия стала биологическим оружием — частью проекта «Мяу»! Вместе с ней в нем участвуют еще четыре девочки, которые еще не знают о своих силах. А сам проект «Мяу» создан для борьбы с химерами — зараженными пришельцами-животными.
В одном из бесчисленных параллельных миров, существующих в пространстве, человечество десятилетиями вело войну против БЕТА, враждебных инопланетных захватчиков. Только благодаря ТНИ (Тактическим Наземным Истребителям) — огромным боевым экзоскелетам — оно смогло дать отпор захватчикам. Но на долго ли его ещё хватит? Эта история о том, как человечество пытается выжить, находясь на грани вымирания...
Раз в 1000 лет все боги мира под предводительством Зевса собираются, чтобы решить судьбу человечества. Встретившись в очередной раз, они приходят к выводу, что люди уже перешли черту и творят непотребство по отношению друг к другу и планете, и единогласно голосуют за истребление человеческой расы. Однако валькирия Брюнхильда предлагает дать людям шанс — отстоять право на существование, сразившись с богами один на один. Божественный совет быстро соглашается, ведь все уверены, что это состязание продемонстрирует всю мощь богов. Брюнхильда отправляется разыскивать выдающихся представителей человеческого рода для участия в смертельных поединках.
Обычная подготовка подростков к летнему лагерю прервалась самым неожиданным образом. Вместе со своим соседом Тайчи узнаёт причину беспорядков. Вся электроника в мегаполисе вышла из строя. Мальчишка понимает, что его родственники, мать и сестра, теперь находятся в огромной опасности. Поезд, на который они сели, находится неизвестно где и, скорее всего, похищен неведомой силой. Необходимо остановить его, и они бегут на ближайшую железнодорожную станцию. Но именно там он внезапно переносится в параллельный, цифровой мир. Именно здесь, в виртуальном Токио, находится причина неприятностей. Кто-то захотел проникнуть в настоящий мир, чтобы обрести власть. Встреча со сражающимся дигимоном становится только началом новых приключений героев. Надежде на спокойную жизнь осуществиться не дано.